Своим возникновением музей обязан Георгию Иосифовичу Пеху (1897-1969), краеведу-энтузиасту, который в 1925-1935 гг. увлечённо собирал предметы волковысской старины, участвовал в археологических раскопках древнего волковысского городища. В 1935 г. на общественных началах в городе был открыт первый краеведческий музей, а коллекция Г.И. Пеха стала основой его экспозиции.
С вхождением Западной Белоруссии в состав БССР (2.11.1939 г.) музей был национализирован и вновь открыт для посетителей 1 января 1940 г. Вскоре началась Великая Отечественная война. Волковыск пострадал от бомбёжек. Музей был разграблен и закрыт.
После войны, 16 апреля 1946 г. Волковысский райисполком принял решение об организации районного краеведческого музея. 9 августа 1946 г. это решение подтвердил Гродненский облисполком. Г.И. Пех вернулся в город и занялся сбором новой музейной коллекции. Благодаря поддержке общества и государства, АН БССР и лично Якуба Коласа, музеев Союза, а также раскопкам, проведённым Г.И. Пехом на месте древнего Волковыска, музейные фонды были пополнены и 1 сентября 1948 г. возрожденный краеведческий музей был официально открыт. В то время он разместился в одном из помещений жилого дома на улице Победы.
В последующие годы были сделаны шаги для изменения профиля волковысского музея. Так, решением горсовета от 15 февраля 1949 г. музей получил прописку в старинном здании помещичьей усадьбы, где в 1812 г. размещался штаб Второй Западной армии ген. Петра Ивановича Багратиона. В 1950 г. у входа в музей был установлен бронзовый бюст выдающегося полководца работы скульптора Заира Азгура. В 1949-1952 гг. музей получил экспонаты расформированного Ленинградского артиллерийского исторического музея, - оружие и снаряжение европейских армий XVIII-XIX вв.
27 февраля 1953 г. Волковысский районный краеведческий музей был преобразован в Военно-исторический музей имени П.И. Багратиона. Г.И. Пех руководил им до 1967 г. Экспозиция музея росла как количественно, так и качественно. Экспонаты охватили огромный пласт истории белорусского народа: от возникновения города, его роста и развития, до событий недавней Великой Отечественной войны.
Растущий музей нуждался в новых выставочных площадях. В 1989 г. началось строительство нового здания музея. 21 сентября 2001 г. новое здание было торжественно открыто. Сейчас в нём разместились экспозиции, посвящённые средневековой истории Волковыска, истории города и района в войнах XX в. и выставочный зал. В фойе посетители знакомятся с историей музея. В старом здании музея размещена экспозиция, посвящённая важнейшим событиям в жизни П.И. Багратиона, его соратников, их борьбе против наполеоновской Франции в 1805-1814 гг. Ряд экспонатов касаются истории Волковысска в период Отечественной войны 1812 г.
Время работы: С 09.00 до 18.00, пн - выходной. работа экспозиции 10:00 - 17:00 без обеда